Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDCP19113 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDCP19113 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDCP19113 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDCP19113 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDCP19113 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HDCP19113 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HDCP19113 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HDCP19113 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDCP19113 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDCP19113 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDCP19113 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDCP19113 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDCP19113 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDCP19113 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDCP19113 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDCP19113 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDCP19113 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HDCP19113 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDCP19113 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDCP19113 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDCP19113 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HDCP19113 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDCP19113 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDCP19113 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDCP19113 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDCP19113 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDCP19113 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDCP19113 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDCP19113 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDCP19113 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDCP19113 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDCP19113 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HDCP19113 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HDCP19113 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HDCP19113 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDCP19113 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HDCP19113 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDCP19113 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDCP19113 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDCP19113 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDCP19113 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDCP19113 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDCP19113 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDCP19113 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDCP19113 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDCP19113 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDCP19113 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDCP19113 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDCP19113 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDCP19113 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDCP19113 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDCP19113 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDCP19113 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDCP19113 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDCP19113 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDCP19113 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDCP19113 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDCP19113 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDCP19113 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDCP19113 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDCP19113 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDCP19113 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDCP19113 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDCP19113 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDCP19113 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDCP19113 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDCP19113 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDCP19113 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDCP19113 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDCP19113 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDCP19113 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDCP19113 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HDCP19113 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDCP19113 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDCP19113 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDCP19113 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDCP19113 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDCP19113 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDCP19113 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDCP19113 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDCP19113 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDCP19113 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HDCP19113 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDCP19113 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HDCP19113 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDCP19113 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDCP19113 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDCP19113 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDCP19113 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDCP19113 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDCP19113 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDCP19113 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDCP19113 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDCP19113 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDCP19113 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDCP19113 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDCP19113 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDCP19113 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDCP19113 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms