Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT15P19012 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT15P19012 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT15P19012 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT15P19012 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT15P19012 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT15P19012 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT15P19012 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT15P19012 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT15P19012 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT15P19012 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT15P19012 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT15P19012 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT15P19012 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT15P19012 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT15P19012 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT15P19012 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT15P19012 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT15P19012 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT15P19012 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT15P19012 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT15P19012 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT15P19012 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT15P19012 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT15P19012 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT15P19012 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT15P19012 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT15P19012 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT15P19012 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT15P19012 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT15P19012 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT15P19012 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT15P19012 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT15P19012 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT15P19012 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT15P19012 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT15P19012 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT15P19012 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT15P19012 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT15P19012 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT15P19012 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT15P19012 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT15P19012 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT15P19012 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT15P19012 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT15P19012 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT15P19012 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT15P19012 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT15P19012 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT15P19012 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT15P19012 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT15P19012 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT15P19012 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT15P19012 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT15P19012 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT15P19012 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT15P19012 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT15P19012 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT15P19012 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT15P19012 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT15P19012 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT15P19012 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT15P19012 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT15P19012 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT15P19012 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT15P19012 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT15P19012 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT15P19012 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT15P19012 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT15P19012 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT15P19012 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT15P19012 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT15P19012 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT15P19012 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT15P19012 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT15P19012 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT15P19012 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT15P19012 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT15P19012 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT15P19012 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT15P19012 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT15P19012 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT15P19012 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT15P19012 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT15P19012 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT15P19012 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT15P19012 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT15P19012 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT15P19012 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT15P19012 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT15P19012 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT15P19012 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT15P19012 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT15P19012 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT15P19012 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT15P19012 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT15P19012 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT15P19012 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT15P19012 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT15P19012 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms