Protein–RNA interactions for Protein: P16104

H2AFX, Histone H2AX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFXP16104 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2AFXP16104 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms