Protein–RNA interactions for Protein: P14652

HOXB2, Homeobox protein Hox-B2, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB2P14652 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXB2P14652 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB2P14652 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms