Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.72■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
TOP2AP11388 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC37.67■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TOP2AP11388 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC37.62■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
TOP2AP11388 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms