Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2P10911 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2P10911 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2P10911 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2P10911 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2P10911 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2P10911 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2P10911 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2P10911 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2P10911 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2P10911 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2P10911 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2P10911 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2P10911 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2P10911 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2P10911 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2P10911 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2P10911 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2P10911 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2P10911 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2P10911 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2P10911 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2P10911 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2P10911 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCF2P10911 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCF2P10911 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCF2P10911 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCF2P10911 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCF2P10911 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCF2P10911 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCF2P10911 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCF2P10911 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCF2P10911 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCF2P10911 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCF2P10911 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCF2P10911 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCF2P10911 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCF2P10911 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MCF2P10911 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCF2P10911 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCF2P10911 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCF2P10911 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCF2P10911 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCF2P10911 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCF2P10911 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCF2P10911 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCF2P10911 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCF2P10911 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCF2P10911 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCF2P10911 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MCF2P10911 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCF2P10911 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCF2P10911 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCF2P10911 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCF2P10911 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCF2P10911 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCF2P10911 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCF2P10911 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCF2P10911 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCF2P10911 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCF2P10911 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCF2P10911 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCF2P10911 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCF2P10911 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCF2P10911 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCF2P10911 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCF2P10911 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCF2P10911 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCF2P10911 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCF2P10911 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCF2P10911 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCF2P10911 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCF2P10911 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCF2P10911 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCF2P10911 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCF2P10911 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCF2P10911 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCF2P10911 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCF2P10911 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCF2P10911 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCF2P10911 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCF2P10911 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCF2P10911 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCF2P10911 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCF2P10911 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCF2P10911 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCF2P10911 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCF2P10911 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCF2P10911 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCF2P10911 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MCF2P10911 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCF2P10911 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCF2P10911 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCF2P10911 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCF2P10911 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCF2P10911 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCF2P10911 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCF2P10911 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCF2P10911 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCF2P10911 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms