Protein–RNA interactions for Protein: P0DP24

CALM2, Calmodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM2P0DP24 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALM2P0DP24 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALM2P0DP24 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALM2P0DP24 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALM2P0DP24 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALM2P0DP24 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALM2P0DP24 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALM2P0DP24 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CALM2P0DP24 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALM2P0DP24 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALM2P0DP24 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALM2P0DP24 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALM2P0DP24 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms