Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CGB3P0DN86 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms