Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms