Protein–RNA interactions for Protein: P0CX15

YRF1-7, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 7, yeastyeast

Predictions only

Length 1,859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-7P0CX15 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.69□□□□□ -1.98
YRF1-7P0CX15 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.69□□□□□ -1.98
YRF1-7P0CX15 SRT1YMR101C 1032 nt2.69□□□□□ -1.98
YRF1-7P0CX15 SMC2YFR031C 3513 nt2.69□□□□□ -1.98
YRF1-7P0CX15 SIN4YNL236W 2925 nt2.68□□□□□ -1.98
YRF1-7P0CX15 SRP68YPL243W 1800 nt2.68□□□□□ -1.98
YRF1-7P0CX15 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt2.68□□□□□ -1.98
YRF1-7P0CX15 YIL092WYIL092W 1902 nt2.68□□□□□ -1.98
YRF1-7P0CX15 ALG1YBR110W 1350 nt2.67□□□□□ -1.98
YRF1-7P0CX15 WHI4YDL224C 1950 nt2.67□□□□□ -1.98
YRF1-7P0CX15 RRP12YPL012W 3687 nt2.67□□□□□ -1.98
YRF1-7P0CX15 YGL159WYGL159W 1113 nt2.67□□□□□ -1.98
YRF1-7P0CX15 YLR302CYLR302C 363 nt2.67□□□□□ -1.98
YRF1-7P0CX15 ATG17YLR423C 1254 nt2.67□□□□□ -1.98
YRF1-7P0CX15 OST6YML019W 999 nt2.67□□□□□ -1.98
YRF1-7P0CX15 FOL3YMR113W 1284 nt2.67□□□□□ -1.98
YRF1-7P0CX15 DYN1YKR054C 12279 nt2.67□□□□□ -1.98
YRF1-7P0CX15 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt2.67□□□□□ -1.98
YRF1-7P0CX15 YMR046CYMR046C 1323 nt2.67□□□□□ -1.98
YRF1-7P0CX15 SPO1YNL012W 1896 nt2.67□□□□□ -1.98
YRF1-7P0CX15 SMI1YGR229C 1518 nt2.67□□□□□ -1.98
YRF1-7P0CX15 CIR1YGR207C 786 nt2.67□□□□□ -1.98
YRF1-7P0CX15 GTR1YML121W 933 nt2.67□□□□□ -1.98
YRF1-7P0CX15 RAS1YOR101W 930 nt2.67□□□□□ -1.98
YRF1-7P0CX15 DIS3YOL021C 3006 nt2.66□□□□□ -1.98
YRF1-7P0CX15 BNA4YBL098W 1383 nt2.66□□□□□ -1.98
YRF1-7P0CX15 SYS1YJL004C 612 nt2.66□□□□□ -1.98
YRF1-7P0CX15 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.66□□□□□ -1.98
YRF1-7P0CX15 PEX11YOL147C 711 nt2.66□□□□□ -1.98
YRF1-7P0CX15 HSH155YMR288W 2916 nt2.65□□□□□ -1.98
YRF1-7P0CX15 YCR050CYCR050C 309 nt2.65□□□□□ -1.98
YRF1-7P0CX15 RPL17BYJL177W 555 nt2.65□□□□□ -1.98
YRF1-7P0CX15 MMM1YLL006W 1281 nt2.65□□□□□ -1.98
YRF1-7P0CX15 YBR300CYBR300C 498 nt2.65□□□□□ -1.98
YRF1-7P0CX15 PUF6YDR496C 1971 nt2.65□□□□□ -1.98
YRF1-7P0CX15 RCY1YJL204C 2523 nt2.65□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 HDA2YDR295C 2025 nt2.65□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 YOL098CYOL098C 3114 nt2.65□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 IOC3YFR013W 2364 nt2.65□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 PEX10YDR265W 1014 nt2.65□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 YER165C-AYER165C-A 357 nt2.65□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.65□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 RPS7AYOR096W 573 nt2.65□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 SIP3YNL257C 3690 nt2.64□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 NRP1YDL167C 2160 nt2.64□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 YHP1YDR451C 1062 nt2.64□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 ISC10YER180C 804 nt2.64□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.64□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 YTH1YPR107C 627 nt2.64□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 KRE33YNL132W 3171 nt2.64□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 VPS13YLL040C 9435 nt2.64□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 BPT1YLL015W 4680 nt2.64□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 NEO1YIL048W 3456 nt2.63□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 YVH1YIR026C 1095 nt2.63□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 YKL091CYKL091C 933 nt2.63□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 KDX1YKL161C 1302 nt2.63□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 TAE2YPL009C 3117 nt2.63□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 SSF2YDR312W 1362 nt2.63□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 ARD1YHR013C 717 nt2.62□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 YIR040CYIR040C 333 nt2.62□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 PST1YDR055W 1335 nt2.62□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 POL30YBR088C 777 nt2.62□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 NDT80YHR124W 1884 nt2.62□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 SFB2YNL049C 2631 nt2.62□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 NAT1YDL040C 2565 nt2.61□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 GPB1YOR371C 2694 nt2.61□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 TIF4631YGR162W 2859 nt2.61□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 NUP100YKL068W 2880 nt2.61□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 REV7YIL139C 738 nt2.61□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 YKL131WYKL131W 522 nt2.61□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 RSM19YNR037C 276 nt2.61□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 RFC5YBR087W 1065 nt2.61□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 GLO3YER122C 1482 nt2.61□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 VPS27YNR006W 1869 nt2.61□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 SSN2YDR443C 4263 nt2.61□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 YDR149CYDR149C 708 nt2.6□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 RPS18AYDR450W 441 nt2.6□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 RPL27AYHR010W 411 nt2.6□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 CDC73YLR418C 1182 nt2.6□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 SSO2YMR183C 888 nt2.6□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 IBA57YJR122W 1494 nt2.6□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 TDA3YHR009C 1572 nt2.6□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 BNR1YIL159W 4128 nt2.6□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 CNM67YNL225C 1746 nt2.6□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 ARP10YDR106W 855 nt2.6□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 PBA1YLR199C 831 nt2.6□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 DCP2YNL118C 2913 nt2.6□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 RTT107YHR154W 3213 nt2.59□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 KAP104YBR017C 2757 nt2.59□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 RRM3YHR031C 2172 nt2.59□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 PCD1YLR151C 1023 nt2.59□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 CPR8YNR028W 927 nt2.59□□□□□ -1.99
YRF1-7P0CX15 MIF2YKL089W 1650 nt2.59□□□□□ -2
YRF1-7P0CX15 DYN2YDR424C 279 nt2.58□□□□□ -2
YRF1-7P0CX15 RPL25YOL127W 429 nt2.58□□□□□ -2
YRF1-7P0CX15 KHA1YJL094C 2622 nt2.58□□□□□ -2
YRF1-7P0CX15 TOP1YOL006C 2310 nt2.58□□□□□ -2
YRF1-7P0CX15 FYV12YOR183W 390 nt2.58□□□□□ -2
YRF1-7P0CX15 OCT1YKL134C 2319 nt2.58□□□□□ -2
YRF1-7P0CX15 HRD3YLR207W 2502 nt2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.8 ms