Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM200BP0CF97 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM200BP0CF97 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms