Protein–RNA interactions for Protein: P08237

PFKM, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKMP08237 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFKMP08237 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFKMP08237 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFKMP08237 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFKMP08237 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFKMP08237 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFKMP08237 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PFKMP08237 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFKMP08237 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFKMP08237 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFKMP08237 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PFKMP08237 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFKMP08237 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFKMP08237 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFKMP08237 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFKMP08237 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFKMP08237 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFKMP08237 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFKMP08237 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFKMP08237 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFKMP08237 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFKMP08237 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFKMP08237 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFKMP08237 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFKMP08237 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFKMP08237 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFKMP08237 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFKMP08237 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFKMP08237 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFKMP08237 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFKMP08237 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFKMP08237 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFKMP08237 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFKMP08237 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFKMP08237 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFKMP08237 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFKMP08237 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFKMP08237 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFKMP08237 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFKMP08237 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFKMP08237 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFKMP08237 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFKMP08237 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFKMP08237 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFKMP08237 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFKMP08237 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFKMP08237 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFKMP08237 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFKMP08237 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFKMP08237 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFKMP08237 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFKMP08237 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFKMP08237 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PFKMP08237 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFKMP08237 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFKMP08237 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFKMP08237 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFKMP08237 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFKMP08237 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PFKMP08237 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PFKMP08237 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PFKMP08237 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PFKMP08237 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PFKMP08237 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PFKMP08237 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PFKMP08237 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PFKMP08237 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PFKMP08237 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PFKMP08237 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PFKMP08237 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PFKMP08237 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PFKMP08237 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PFKMP08237 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PFKMP08237 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PFKMP08237 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PFKMP08237 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PFKMP08237 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PFKMP08237 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PFKMP08237 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PFKMP08237 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PFKMP08237 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PFKMP08237 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PFKMP08237 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PFKMP08237 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PFKMP08237 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PFKMP08237 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PFKMP08237 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PFKMP08237 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PFKMP08237 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PFKMP08237 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PFKMP08237 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PFKMP08237 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PFKMP08237 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PFKMP08237 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PFKMP08237 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PFKMP08237 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PFKMP08237 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PFKMP08237 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PFKMP08237 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PFKMP08237 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms