Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPM2P07951 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPM2P07951 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPM2P07951 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPM2P07951 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPM2P07951 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPM2P07951 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPM2P07951 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPM2P07951 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPM2P07951 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPM2P07951 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPM2P07951 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPM2P07951 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPM2P07951 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPM2P07951 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPM2P07951 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPM2P07951 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPM2P07951 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPM2P07951 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPM2P07951 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TPM2P07951 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPM2P07951 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPM2P07951 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPM2P07951 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPM2P07951 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPM2P07951 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPM2P07951 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TPM2P07951 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPM2P07951 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPM2P07951 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPM2P07951 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPM2P07951 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPM2P07951 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TPM2P07951 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TPM2P07951 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPM2P07951 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPM2P07951 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPM2P07951 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPM2P07951 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPM2P07951 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPM2P07951 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPM2P07951 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPM2P07951 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPM2P07951 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPM2P07951 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPM2P07951 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPM2P07951 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPM2P07951 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPM2P07951 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TPM2P07951 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TPM2P07951 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPM2P07951 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPM2P07951 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPM2P07951 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPM2P07951 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPM2P07951 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPM2P07951 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPM2P07951 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPM2P07951 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPM2P07951 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPM2P07951 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPM2P07951 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPM2P07951 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPM2P07951 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPM2P07951 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPM2P07951 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPM2P07951 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPM2P07951 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPM2P07951 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPM2P07951 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPM2P07951 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TPM2P07951 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPM2P07951 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TPM2P07951 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPM2P07951 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPM2P07951 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPM2P07951 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TPM2P07951 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TPM2P07951 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPM2P07951 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPM2P07951 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TPM2P07951 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPM2P07951 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TPM2P07951 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TPM2P07951 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPM2P07951 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPM2P07951 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPM2P07951 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPM2P07951 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPM2P07951 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPM2P07951 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPM2P07951 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPM2P07951 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPM2P07951 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPM2P07951 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPM2P07951 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPM2P07951 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPM2P07951 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPM2P07951 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPM2P07951 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms