Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB3P05106 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms