Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNAP02545 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNAP02545 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNAP02545 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNAP02545 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNAP02545 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNAP02545 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNAP02545 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNAP02545 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNAP02545 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNAP02545 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNAP02545 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNAP02545 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNAP02545 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNAP02545 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNAP02545 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNAP02545 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNAP02545 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNAP02545 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNAP02545 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNAP02545 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNAP02545 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNAP02545 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNAP02545 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNAP02545 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNAP02545 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNAP02545 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNAP02545 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNAP02545 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNAP02545 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNAP02545 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNAP02545 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNAP02545 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNAP02545 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNAP02545 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNAP02545 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMNAP02545 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMNAP02545 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMNAP02545 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMNAP02545 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMNAP02545 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMNAP02545 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMNAP02545 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMNAP02545 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMNAP02545 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LMNAP02545 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMNAP02545 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNAP02545 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNAP02545 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNAP02545 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNAP02545 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNAP02545 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNAP02545 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNAP02545 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNAP02545 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNAP02545 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNAP02545 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNAP02545 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNAP02545 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNAP02545 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNAP02545 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNAP02545 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNAP02545 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNAP02545 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNAP02545 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNAP02545 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNAP02545 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNAP02545 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNAP02545 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNAP02545 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNAP02545 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNAP02545 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNAP02545 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNAP02545 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNAP02545 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNAP02545 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNAP02545 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNAP02545 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNAP02545 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNAP02545 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNAP02545 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNAP02545 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNAP02545 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNAP02545 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNAP02545 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNAP02545 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNAP02545 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNAP02545 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNAP02545 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNAP02545 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNAP02545 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNAP02545 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNAP02545 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNAP02545 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNAP02545 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNAP02545 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNAP02545 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNAP02545 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNAP02545 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNAP02545 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms