Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms