Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB6O95452 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB6O95452 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB6O95452 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB6O95452 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB6O95452 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB6O95452 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB6O95452 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB6O95452 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB6O95452 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB6O95452 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB6O95452 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB6O95452 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB6O95452 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB6O95452 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB6O95452 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB6O95452 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB6O95452 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB6O95452 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB6O95452 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB6O95452 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB6O95452 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB6O95452 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB6O95452 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB6O95452 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB6O95452 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB6O95452 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB6O95452 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB6O95452 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB6O95452 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB6O95452 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB6O95452 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB6O95452 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB6O95452 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB6O95452 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB6O95452 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB6O95452 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB6O95452 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB6O95452 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB6O95452 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB6O95452 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB6O95452 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB6O95452 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB6O95452 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB6O95452 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB6O95452 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB6O95452 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB6O95452 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB6O95452 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB6O95452 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB6O95452 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB6O95452 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB6O95452 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB6O95452 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB6O95452 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB6O95452 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB6O95452 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB6O95452 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB6O95452 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB6O95452 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB6O95452 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB6O95452 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB6O95452 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB6O95452 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB6O95452 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB6O95452 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB6O95452 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB6O95452 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB6O95452 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB6O95452 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB6O95452 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB6O95452 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB6O95452 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB6O95452 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB6O95452 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB6O95452 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB6O95452 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB6O95452 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB6O95452 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB6O95452 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB6O95452 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB6O95452 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB6O95452 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB6O95452 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB6O95452 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB6O95452 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB6O95452 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB6O95452 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB6O95452 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJB6O95452 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB6O95452 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB6O95452 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB6O95452 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB6O95452 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB6O95452 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB6O95452 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB6O95452 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB6O95452 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB6O95452 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB6O95452 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms