Protein–RNA interactions for Protein: O75678

RFPL2, Ret finger protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL2O75678 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RFPL2O75678 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFPL2O75678 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms