Protein–RNA interactions for Protein: O75604

USP2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP2O75604 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP2O75604 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP2O75604 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP2O75604 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP2O75604 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP2O75604 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
USP2O75604 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP2O75604 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP2O75604 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP2O75604 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP2O75604 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP2O75604 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP2O75604 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP2O75604 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP2O75604 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP2O75604 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP2O75604 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP2O75604 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP2O75604 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP2O75604 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP2O75604 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP2O75604 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP2O75604 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP2O75604 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP2O75604 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP2O75604 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP2O75604 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP2O75604 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP2O75604 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
USP2O75604 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP2O75604 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
USP2O75604 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP2O75604 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP2O75604 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
USP2O75604 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP2O75604 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP2O75604 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP2O75604 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP2O75604 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP2O75604 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP2O75604 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP2O75604 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP2O75604 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP2O75604 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP2O75604 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
USP2O75604 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP2O75604 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
USP2O75604 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP2O75604 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP2O75604 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP2O75604 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP2O75604 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP2O75604 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP2O75604 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP2O75604 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP2O75604 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP2O75604 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP2O75604 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP2O75604 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP2O75604 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP2O75604 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP2O75604 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP2O75604 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP2O75604 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP2O75604 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP2O75604 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP2O75604 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP2O75604 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP2O75604 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP2O75604 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP2O75604 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP2O75604 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP2O75604 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP2O75604 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
USP2O75604 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP2O75604 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP2O75604 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP2O75604 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP2O75604 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP2O75604 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP2O75604 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP2O75604 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP2O75604 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP2O75604 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP2O75604 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP2O75604 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP2O75604 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP2O75604 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP2O75604 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP2O75604 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP2O75604 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP2O75604 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP2O75604 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP2O75604 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP2O75604 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP2O75604 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP2O75604 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP2O75604 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
USP2O75604 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP2O75604 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms