Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA2O75334 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA2O75334 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms