Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG13O75143 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG13O75143 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG13O75143 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG13O75143 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG13O75143 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG13O75143 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG13O75143 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG13O75143 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG13O75143 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG13O75143 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG13O75143 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG13O75143 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG13O75143 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG13O75143 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG13O75143 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG13O75143 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG13O75143 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG13O75143 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG13O75143 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG13O75143 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG13O75143 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG13O75143 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG13O75143 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG13O75143 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG13O75143 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG13O75143 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG13O75143 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG13O75143 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG13O75143 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG13O75143 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG13O75143 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG13O75143 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG13O75143 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG13O75143 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG13O75143 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG13O75143 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG13O75143 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG13O75143 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG13O75143 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG13O75143 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG13O75143 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG13O75143 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG13O75143 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG13O75143 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG13O75143 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG13O75143 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG13O75143 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG13O75143 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG13O75143 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG13O75143 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG13O75143 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG13O75143 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG13O75143 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG13O75143 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG13O75143 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG13O75143 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG13O75143 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG13O75143 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG13O75143 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG13O75143 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG13O75143 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG13O75143 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATG13O75143 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATG13O75143 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATG13O75143 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATG13O75143 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG13O75143 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG13O75143 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG13O75143 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG13O75143 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG13O75143 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG13O75143 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG13O75143 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG13O75143 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG13O75143 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG13O75143 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG13O75143 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG13O75143 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG13O75143 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG13O75143 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG13O75143 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG13O75143 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG13O75143 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG13O75143 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG13O75143 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG13O75143 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG13O75143 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG13O75143 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG13O75143 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG13O75143 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG13O75143 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG13O75143 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG13O75143 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG13O75143 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG13O75143 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG13O75143 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG13O75143 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG13O75143 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG13O75143 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms