Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXD2O60548 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
FOXD2O60548 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FOXD2O60548 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FOXD2O60548 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FOXD2O60548 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FOXD2O60548 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FOXD2O60548 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FOXD2O60548 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD2O60548 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD2O60548 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD2O60548 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD2O60548 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD2O60548 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD2O60548 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD2O60548 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD2O60548 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD2O60548 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FOXD2O60548 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD2O60548 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD2O60548 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD2O60548 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD2O60548 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD2O60548 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD2O60548 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD2O60548 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD2O60548 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD2O60548 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD2O60548 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD2O60548 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD2O60548 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD2O60548 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD2O60548 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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