Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DENRO43583 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DENRO43583 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DENRO43583 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DENRO43583 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DENRO43583 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DENRO43583 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DENRO43583 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DENRO43583 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DENRO43583 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
DENRO43583 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DENRO43583 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DENRO43583 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DENRO43583 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DENRO43583 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DENRO43583 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DENRO43583 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DENRO43583 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DENRO43583 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DENRO43583 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DENRO43583 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DENRO43583 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DENRO43583 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
DENRO43583 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DENRO43583 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DENRO43583 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DENRO43583 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DENRO43583 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DENRO43583 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DENRO43583 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DENRO43583 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DENRO43583 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DENRO43583 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DENRO43583 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DENRO43583 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DENRO43583 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DENRO43583 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
DENRO43583 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DENRO43583 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DENRO43583 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DENRO43583 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
DENRO43583 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DENRO43583 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DENRO43583 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DENRO43583 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DENRO43583 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DENRO43583 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DENRO43583 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DENRO43583 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DENRO43583 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DENRO43583 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DENRO43583 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DENRO43583 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DENRO43583 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DENRO43583 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DENRO43583 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DENRO43583 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DENRO43583 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DENRO43583 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DENRO43583 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DENRO43583 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DENRO43583 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DENRO43583 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DENRO43583 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
DENRO43583 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DENRO43583 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DENRO43583 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DENRO43583 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DENRO43583 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DENRO43583 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DENRO43583 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DENRO43583 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DENRO43583 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DENRO43583 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DENRO43583 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DENRO43583 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DENRO43583 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DENRO43583 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DENRO43583 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DENRO43583 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DENRO43583 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DENRO43583 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DENRO43583 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DENRO43583 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DENRO43583 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DENRO43583 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DENRO43583 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DENRO43583 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DENRO43583 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DENRO43583 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DENRO43583 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DENRO43583 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
DENRO43583 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DENRO43583 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
DENRO43583 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DENRO43583 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DENRO43583 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DENRO43583 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DENRO43583 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DENRO43583 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms