Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSI1O43347 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSI1O43347 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSI1O43347 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MSI1O43347 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSI1O43347 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSI1O43347 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSI1O43347 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSI1O43347 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSI1O43347 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSI1O43347 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSI1O43347 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSI1O43347 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSI1O43347 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSI1O43347 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSI1O43347 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MSI1O43347 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSI1O43347 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSI1O43347 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSI1O43347 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSI1O43347 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSI1O43347 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSI1O43347 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSI1O43347 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSI1O43347 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSI1O43347 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSI1O43347 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSI1O43347 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSI1O43347 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSI1O43347 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSI1O43347 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSI1O43347 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSI1O43347 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSI1O43347 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSI1O43347 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSI1O43347 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSI1O43347 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSI1O43347 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSI1O43347 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSI1O43347 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSI1O43347 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSI1O43347 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSI1O43347 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSI1O43347 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSI1O43347 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSI1O43347 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSI1O43347 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSI1O43347 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSI1O43347 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSI1O43347 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSI1O43347 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MSI1O43347 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSI1O43347 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MSI1O43347 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MSI1O43347 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSI1O43347 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSI1O43347 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSI1O43347 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSI1O43347 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSI1O43347 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSI1O43347 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSI1O43347 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSI1O43347 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSI1O43347 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSI1O43347 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSI1O43347 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSI1O43347 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSI1O43347 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSI1O43347 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSI1O43347 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSI1O43347 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSI1O43347 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSI1O43347 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSI1O43347 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSI1O43347 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSI1O43347 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSI1O43347 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSI1O43347 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSI1O43347 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSI1O43347 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSI1O43347 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSI1O43347 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSI1O43347 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSI1O43347 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSI1O43347 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSI1O43347 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSI1O43347 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSI1O43347 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSI1O43347 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSI1O43347 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSI1O43347 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSI1O43347 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSI1O43347 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSI1O43347 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSI1O43347 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSI1O43347 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MSI1O43347 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSI1O43347 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSI1O43347 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSI1O43347 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms