Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC7A4O43246 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC7A4O43246 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms