Protein–RNA interactions for Protein: O15226

NKRF, NF-kappa-B-repressing factor, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKRFO15226 EPS8L2-219ENST00000531348 582 ntTSL 220.59■□□□□ 0.891e-33■■□□□ 13.3
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NKRFO15226 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.431e-33■■□□□ 13.3
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NKRFO15226 EPS8L2-214ENST00000529680 551 ntTSL 417.54■□□□□ 0.41e-33■■□□□ 13.3
NKRFO15226 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.391e-33■■□□□ 13.3
NKRFO15226 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.381e-33■■□□□ 13.3
NKRFO15226 EPS8L2-208ENST00000526909 3844 ntTSL 514.13□□□□□ -0.151e-33■■□□□ 13.3
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NKRFO15226 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.552e-13■■□□□ 13.2
NKRFO15226 MIR193BHG-208ENST00000641175 619 nt19.49■□□□□ 0.716e-7■■□□□ 13.2
NKRFO15226 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.665e-9■■□□□ 13.2
NKRFO15226 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.545e-9■■□□□ 13.2
NKRFO15226 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.025e-9■■□□□ 13.2
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NKRFO15226 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.899e-7■■□□□ 13.2
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NKRFO15226 SHANK2-214ENST00000468619 2775 ntTSL 214.76□□□□□ -0.051e-6■■□□□ 13.2
NKRFO15226 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.91e-7■■□□□ 13.2
NKRFO15226 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.861e-7■■□□□ 13.2
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NKRFO15226 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.811e-7■■□□□ 13.2
NKRFO15226 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.71e-7■■□□□ 13.2
NKRFO15226 CTIF-206ENST00000588345 584 ntTSL 321.37■■□□□ 1.016e-7■■□□□ 13.2
NKRFO15226 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.252e-7■■□□□ 13.2
NKRFO15226 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.246e-7■■□□□ 13.2
NKRFO15226 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.226e-7■■□□□ 13.2
NKRFO15226 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.096e-7■■□□□ 13.2
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NKRFO15226 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.796e-7■■□□□ 13.2
NKRFO15226 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.766e-7■■□□□ 13.2
NKRFO15226 HDGF-209ENST00000495212 744 ntTSL 323.2■■□□□ 1.36e-7■■□□□ 13.2
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NKRFO15226 HDGF-205ENST00000469145 844 ntTSL 222.5■■□□□ 1.196e-7■■□□□ 13.2
NKRFO15226 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.796e-7■■□□□ 13.2
NKRFO15226 MMD-203ENST00000577038 570 ntTSL 219.49■□□□□ 0.716e-7■■□□□ 13.2
NKRFO15226 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.626e-7■■□□□ 13.2
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NKRFO15226 HDGF-204ENST00000465180 2060 ntTSL 1 (best)17.17■□□□□ 0.346e-7■■□□□ 13.2
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NKRFO15226 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.176e-7■■□□□ 13.2
NKRFO15226 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.046e-7■■□□□ 13.2
NKRFO15226 HDGF-203ENST00000368209 2171 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.046e-7■■□□□ 13.2
NKRFO15226 AC073610.2-201ENST00000537495 406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.096e-7■■□□□ 13.2
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NKRFO15226 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.62e-6■■□□□ 13.2
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NKRFO15226 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.132e-6■■□□□ 13.2
NKRFO15226 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.842e-6■■□□□ 13.2
NKRFO15226 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.937e-7■■□□□ 13.2
NKRFO15226 TBC1D16-201ENST00000310924 10936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.623e-6■■□□□ 13.2
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NKRFO15226 FBXO31-204ENST00000565593 2717 ntTSL 522.34■■□□□ 1.172e-6■■□□□ 13.2
NKRFO15226 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.172e-6■■□□□ 13.2
NKRFO15226 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.722e-6■■□□□ 13.2
NKRFO15226 FBXO31-202ENST00000561664 305 ntTSL 516.58■□□□□ 0.242e-6■■□□□ 13.2
NKRFO15226 DYRK1A-207ENST00000462274 1189 ntTSL 1 (best)29.67■■■□□ 2.345e-8■■□□□ 13.2
NKRFO15226 DYRK1A-209ENST00000608928 483 ntTSL 525.24■■□□□ 1.635e-8■■□□□ 13.2
NKRFO15226 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.091e-11■■□□□ 13.2
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NKRFO15226 SLC16A3-220ENST00000584781 562 ntTSL 426.44■■□□□ 1.821e-11■■□□□ 13.2
NKRFO15226 SLC16A3-208ENST00000579572 863 ntTSL 323.37■■□□□ 1.331e-11■■□□□ 13.2
NKRFO15226 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.231e-11■■□□□ 13.2
NKRFO15226 SLC16A3-206ENST00000578684 866 ntTSL 321.22■□□□□ 0.991e-11■■□□□ 13.2
NKRFO15226 SLC16A3-219ENST00000584689 1033 ntTSL 221.11■□□□□ 0.971e-11■■□□□ 13.2
NKRFO15226 SLC16A3-217ENST00000583237 808 ntTSL 321.02■□□□□ 0.961e-11■■□□□ 13.2
NKRFO15226 SLC16A3-212ENST00000581642 557 ntTSL 420.94■□□□□ 0.941e-11■■□□□ 13.2
NKRFO15226 SLC16A3-203ENST00000577650 545 ntTSL 320.11■□□□□ 0.811e-11■■□□□ 13.2
NKRFO15226 SLC16A3-213ENST00000582715 279 ntTSL 517.96■□□□□ 0.471e-11■■□□□ 13.2
NKRFO15226 UBE2J2-207ENST00000435198 1056 ntTSL 330.7■■■□□ 2.512e-6■■□□□ 13.2
NKRFO15226 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.942e-6■■□□□ 13.2
NKRFO15226 UBE2J2-210ENST00000464036 1256 ntTSL 327.07■■□□□ 1.922e-6■■□□□ 13.2
NKRFO15226 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.572e-6■■□□□ 13.2
NKRFO15226 UBE2J2-209ENST00000461142 837 ntTSL 324.81■■□□□ 1.562e-6■■□□□ 13.2
NKRFO15226 UBE2J2-214ENST00000473215 1028 ntTSL 324.65■■□□□ 1.542e-6■■□□□ 13.2
NKRFO15226 UBE2J2-206ENST00000422076 643 ntTSL 524.45■■□□□ 1.52e-6■■□□□ 13.2
NKRFO15226 UBE2J2-219ENST00000503294 814 ntTSL 424.45■■□□□ 1.52e-6■■□□□ 13.2
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