Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAMP3O14828 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms