Protein–RNA interactions for Protein: O00463

TRAF5, TNF receptor-associated factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5O00463 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRAF5O00463 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms