Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
POLRMTO00411 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLRMTO00411 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
POLRMTO00411 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms