Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCER2I3L3R5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms