Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms