Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PROB1E7EW31 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PROB1E7EW31 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms