Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGTLC3B5MD39 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms