Protein–RNA interactions for Protein: A8MTJ6

FOXI3, Forkhead box protein I3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI3A8MTJ6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FOXI3A8MTJ6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXI3A8MTJ6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms