Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RTL1A6NKG5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RTL1A6NKG5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RTL1A6NKG5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTL1A6NKG5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTL1A6NKG5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTL1A6NKG5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTL1A6NKG5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTL1A6NKG5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms