Protein–RNA interactions for Protein: A6NIJ5

FAM90A20P, Putative protein FAM90A20P, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM90A20PA6NIJ5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM90A20PA6NIJ5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM90A20PA6NIJ5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM90A20PA6NIJ5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM90A20PA6NIJ5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM90A20PA6NIJ5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM90A20PA6NIJ5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM90A20PA6NIJ5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM90A20PA6NIJ5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM90A20PA6NIJ5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM90A20PA6NIJ5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM90A20PA6NIJ5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM90A20PA6NIJ5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM90A20PA6NIJ5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM90A20PA6NIJ5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM90A20PA6NIJ5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM90A20PA6NIJ5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM90A20PA6NIJ5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
FAM90A20PA6NIJ5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM90A20PA6NIJ5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms