Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
GOLGA6L9A6NEM1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms