Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00862A6NCI5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms