Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms