Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 PCP2-202ENST00000598935 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PTPRJQ12913 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 PTPRT-212ENST00000620410 940 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 PUDPP2-202ENST00000628080 737 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 AC006453.2-203ENST00000637196 774 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 AC002511.3-201ENST00000638098 420 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 IL7-211ENST00000639719 597 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 IL18R1-203ENST00000409599 3854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PTPRJQ12913 TM2D3-202ENST00000347970 1329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 ZNF625-202ENST00000439556 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 ZC4H2-202ENST00000374839 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 SNRK-202ENST00000429705 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 PPP4R1L-201ENST00000244070 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 GRM4-204ENST00000535756 6670 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 PNPLA7-201ENST00000277531 4581 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PTPRJQ12913 YY1AP1-209ENST00000368330 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 CREB3L4-205ENST00000368607 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 ZSCAN21-205ENST00000543588 1870 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 ANKRD36-206ENST00000620383 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 ANKRD62-202ENST00000587848 2919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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PTPRJQ12913 MKNK2-213ENST00000591601 3582 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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PTPRJQ12913 CD3D-201ENST00000300692 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 ABL1-202ENST00000372348 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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PTPRJQ12913 AC008268.1-201ENST00000425887 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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PTPRJQ12913 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 ERVMER34-1-201ENST00000440542 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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PTPRJQ12913 PCOTH-203ENST00000435039 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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PTPRJQ12913 RIPOR1-205ENST00000540839 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 DNM1P28-201ENST00000565702 474 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 B9D1-213ENST00000575403 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 AC010761.4-201ENST00000577325 521 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 AC015849.1-201ENST00000605548 662 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 PITX2-213ENST00000616641 3102 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 MED15P1-202ENST00000620166 906 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 MPP2-220ENST00000622681 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 LINC00976-203ENST00000630386 866 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 AC009542.2-204ENST00000636543 433 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 RNF115-202ENST00000582693 9117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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