Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00312Q9Y6C7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00312Q9Y6C7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms