Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms