Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX13Q9Y5W8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
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SNX13Q9Y5W8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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SNX13Q9Y5W8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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SNX13Q9Y5W8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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SNX13Q9Y5W8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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SNX13Q9Y5W8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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SNX13Q9Y5W8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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SNX13Q9Y5W8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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