Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms