Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AFG3L2Q9Y4W6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AFG3L2Q9Y4W6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms