Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFR3BQ9Y2G0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFR3BQ9Y2G0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms