Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
TRAK1Q9UPV9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRAK1Q9UPV9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRAK1Q9UPV9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms