Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FZD1Q9UP38 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FZD1Q9UP38 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms