Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF18Q9UNG2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms