Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms